El Centro Universitario de Tonalá cuenta actualmente con dos sedes: la ubicada temporalmente en la Casa de la Cultura II, Morelos No. 155 B, en el centro del municipio de Tonalá, y en la sede definitiva: Av. Nuevo Periférico 555, Ejido San José Tateposco, C.P 48525, Tonalá. Está organizada con el sistema de clasificación Dewey o decimal, que es un lenguaje alfanumérico codificado el cual agrupa los materiales de acuerdo al área de conocimiento. Tiene 10 ejes temáticos principales:
- 000 - Ciencia de los computadores, información y obras generales
- 100 - Filosofía y psicología
- 200 - Religión, teología
- 300 - Ciencias sociales
- 400 - Lenguas
- 500 - Ciencia
- 600 - Tecnología
- 700 - Artes y recreación
- 800 - Literatura
- 900 - Historia y geografía
Cuenta con más de 36,000 volúmenes de todas las carreras que ofrece el Centro.